Chemistry Researches

Chemistry Researches

بررسی محاسباتی برهم‌کنش‌های مولکولی بین آمیودارون و β-سیکلودکسترین و استیل-β-سیکلودکسترین: رویکرد داکینگ و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان
1 گروه شیمی فیزیک، دانشکده شیمی ، دانشگاه مازندران، بابلسر، مازندران، ایران
2 گروه شیمی فیزیک، دانشکده شیمی، دانشگاه مازندران، بابلسر، مازندران، ایران
10.22036/cr.2025.535375.1285
چکیده
آمیودارون(AMD) یکی از داروهای مؤثر در درمان آریتمی‌های قلبی است، اما به دلیل بروز عوارض جانبی، استفاده طولانی‌مدت از آن با محدودیت‌هایی همراه است. نظر به اهمیت سامانه‌های نوین دارورسانی به‌منظور افزایش اثربخشی و کاهش عوارض جانبی سیستمیک این دارو، در این پژوهش تشکیل کمپلکس‌های درهم‌جای (IC) میان دارو و دو نوع سیکلودکسترین، βCD طبیعی و مشتق‌شده با گروه استیل (AC-βCD)، با استفاده از روش‌های محاسباتی داکینگ مولکولی و شبیه‌سازی دینامیک مولکولی بررسی شد. نتایج نشان داد که کمپلکس درهم‌جای AC-βCD: AMD نسبت به کمپلکس درهم‌جای βCD:AMD دارای انرژی اتصال منفی‌تر، تعداد پیوندهای هیدروژنی بیشتر و پایداری بالاتر در محیط آبی است. تحلیل تابع توزیع شعاعی، فاصله مرکز جرم، و انرژی برهم‌کنش‌ها نیز بر مزیت مشتق‌سازی βCD برای طراحی حامل‌های دارورسانی مؤثرتر تاکید دارد. در مجموع، این نانوحامل‌ها به ویژه AC-βCD، پتانسیل بالایی برای طراحی سامانه‌‌های دارورسانی هدفمند داشته و می‌توانند اثربخشی درمانی AMD را افزایش داده و عوارض جانبی آن را کاهش دهند.
کلیدواژه‌ها
موضوعات

عنوان مقاله English

Computational Study of Molecular Interactions between Amiodarone and β-Cyclodextrin and Acetyl-β-Cyclodextrin: A Docking and Molecular Dynamics Simulation Approach

نویسندگان English

Fatemeh Sadat Fateminasab 1
Effat Kianpour 2
1 Department of physical chemistry, Faculty of Chemistry, University of Mazandaran, , Babolsar, Mazandaran, Iran
2 Department of physical chemistry, Faculty of Chemistry, University of Mazandaran, Babolsar, Mazandaran, Iran
چکیده English

Amiodarone (AMD) is an effective drug for treating cardiac arrhythmias, but its long-term use is limited due to side effects. Considering the importance of advanced drug delivery systems to enhance efficacy and reduce side effects of this drug, this study investigated the formation of inclusion complexes (ICs) between the drug and two types of cyclodextrins (CDs), natural βCD and acetylated βCD (AC-βCD), using molecular docking and molecular dynamics simulation methods. The results showed that the AC-βCD: AMD IC had a more negative binding energy, more hydrogen bonds, and higher stability in an aqueous environment compared to the βCD: AMD IC. The analysis of radial distribution function, center of mass distance, and interaction energy further emphasized the advantage of βCD derivatization for designing more effective drug delivery carriers. Overall, these nanocarriers, particularly AC-βCD, show great potential for the development of targeted drug delivery systems and may enhance the therapeutic efficacy of AMD while reducing its side effects.

کلیدواژه‌ها English

Molecular Docking
Molecular Dynamics
Drug Delivery
Cyclodextrin
Amiodarone

  • تاریخ دریافت 27 تیر 1404
  • تاریخ بازنگری 05 شهریور 1404
  • تاریخ پذیرش 10 شهریور 1404